Стационарные наблюдения экспедиции, как и в прошлые годы, проводились в обсерватории Мирный и на станциях Молодежная, Восток, Новолазаревская. На всех этих станциях выполнялись систематические наблюдения по аэрометеорологии, геофизике, гляциологии и медицине. В Мирном и на станции Молодежной велись океанологические исследования.
В программу зимовочных работ экспедиции были включены новые исследования. Так, в обсерватории Мирный, на станциях Молодежная и Восток были организованы геодезические наблюдения. В Мирном продолжались экспериментальные работы по бурению ледникового покрова.
Иностранные специалисты, радиофизики из Германской Демократической Республики, принимали сигналы искусственных метеорологических спутников.
22 февраля 1968 г. Тринадцатой экспедицией в районе Антарктического полуострова была открыта новая советская южнополярная станция Беллинсгаузен на о. Ватерлоо (Кинг-Джордж). На этой первой советской станции в западном секторе Антарктики были организованы наблюдения по метеорологии, актинометрии, океанологии, гляциологии, физической географии и медицине.
Научные наблюдения в период этой экспедиции в обсерватории Мирный продолжались 382 дня, на станциях Молодежная — 359, Восток — 382, Новолазаревская — 354 и Беллинсгаузен — 349 дней.